Es gibt gute Virenscanner Boot-CDs, die unabhängig vom Betriebssystem laufen. Man bootet quasi nicht in Windows rein, sondern über die CD und kann so das System in Ruhe scannen lassen. Rootkits werden nämlich von den meisten Virenscannern nicht erfasst, genau wie ADS-Viren. Auch gibt es Viren, die sich zum Zeitpunkt des Scans auf inaktiv stellen und sobald der Scan vorbei ist, wieder aktiv werden. Die lassen sich nur dadurch erkennen, dass man das System "von aussen" scannt.
Bestes Beispiel für einen Vertreter dieser Rettungs-CDs ist
Knoppicillin ? Wikipedia