Ok, gewuchtet hatte Du die ja. Du musst aber auch bedenken, dass die anderen Felgen sicherlich eine andere ET haben und sich die Achse dadurch leicht verändert. So können plötzlich Probleme auftreten, die bei anderen Rädern nicht bemerkt werden.
Wenn es nur beim Bremsen passiert, muss es nicht gleich eine krumme Bremsscheibe sein. Das hättest auch im Pedal mit Sommerreifen gemerkt.
Würde auch vermuten, dass die Nabe verdreckt ist und die Felge nicht plan anliegt. Aber auch dann würde die Kiste nur eiern, wenn da eine Felge schief sitzt. Radblozen sind ja hoffentlich fest.

Trotzdem mal schauen, ob auch das Achsspiel passt. Wie gesagt, mit anderer ET kommen manchmal Dinge zum Vorschein, die vorher nicht da waren.
Radbolzen nochmal nachziehen. Beim Bremsen wirken auch andere Krräfte auf die Räder.