Ähnliches Problem hatte ich mal vor einigen Jahren. Die einfache Übertragung des Masters reicht nicht aus. Kann jetzt aus dem Stehgreif leider nicht sagen, welche Dienste da noch manuell umgeschwenkt werden müssen...aber es gibt hier einige, bei denen es unter mysteriösen Umständen nicht immer automatisch klappt.
Anschließend sollten die Server ruhig noch ein paar Stunden weiterlaufen, um in Ruhe zu synchronisieren.
Verstehen kann ich dieses Verhalten jedoch auch nicht so wirklich, da hinter dem AD-Konzept seit W2K eigentlich auch eine bessere Ausfallsicherheit stecken sollte