Pollenfilter schützen vor - Überraschung - Pollen und auch Grobstaub, Dreck usw.
Aktivkohlefilter haben den gleichen Schutzfaktor, filtern aber auch noch bestimmte Gerüche und sind - soweit ich weiß - auch noch etwas effektiver in der Staubhemmung.
Nachteil gibt es keine - außer, dass der Lüfter natürlich etwas mehr saugen muss und damit die Frischluftzufuhr geringer ausfällt als ohne Filter