Solange bei diesem Flash-Update nicht irgend etwas völlig danebenginge, dürfte das auf die Darstellung von Webseiten keinen Einfluß haben, schon gar nicht einen solchen wie bei dir bzw. ebay/wkw.
Was die Toolbars angeht: die installieren sich nur dann mit, wenn man sie gewähren läßt! Man hat eigentlich immer die Möglichkeit, den Haken vor "Toolbar XY installieren" zu entfernen, wenn man sich durch die Installationsroutine einer anderen Software klickt, man muß nur etwas genauer hinsehen.
In deinem Fall würde ich nicht groß herumdoktern, sondern ein neues Firefox-Profil anlegen. Wie das geht, kannst du
hier nachlesen. Mit diesem hast du nichts anderes als eine komplett jungfräuliche "Version" von Firefox, sodaß du danach die nötigen Plugins und Erweiterungen installieren kannst, ohne die ganzen Toolbars oder u.U. vermurkste Updates an der Backe zu haben.